导致持仓股上涨，基金净值还跌的原因如下：
1、基金所募集的资金没有百分百的投资于股票，即基金为保证基金流动性来应对申赎，会把一些资金投资于一些比较灵活的货币市场，或者其募集的资金只投资某一指数的一部分股票，从而导致股票涨了，基金净值不涨，甚至下跌的情况。
2、投资者在交易基金时，需要交纳一定的申购费用、赎回费用、托管费用、销售服务费用以及管理费用，其中管理费用、托管费用以及销售服务费用是在基金净值中计提的，从而也会导致基金净值涨跌和所投资的股票涨跌幅不一致。
3、基金持仓在每个季度结束之日起的15个交易日内才公布，具有一定的滞后性，即基金实际持仓与其公布的持仓不一样，则也可能会导致持仓股涨基金净值还跌。