银行卡是储蓄卡，没有透支功能，如果里面没有钱。是不会进行扣费的。而且储蓄卡没有卡费的。有效期内一般是不会自动注销的。但是长期不用的卡，会被银行限制“非柜交易”，比如你想网银转账或者扫码付款，都是无法操作的。限制非柜交易后，就只能去银行网点柜台办理业务了。
银行卡一般都是免费办理的，所以不会收取你的卡费，只有信用卡才会有年费。需要每年消费几次，可以才可以减免，有些高端白金卡，需要使用积分抵扣年费。但是储蓄卡是没有任何年费和管理费的。
所以你即使不用，它也不会收取你的任何费用。但是如果你开通一些收费服务，比如短信服务费。这个时候如果会每月从你的储蓄卡里面扣钱，但是如果你的银行卡里面，没有钱了。那么银行就无法划扣了，长时间不用，这个短信提醒服务，也会自动取消的。因为储蓄卡是没有透支功能的，所以没有钱的情况，就无法扣费。
银行卡的有效期一般为10年，只要在有效期内，那么银行是无法给你注销的。过了有效期，如果你没有进行补卡，那么原来的老卡就无法正常使用了。而且银行卡注销，必须本人带着身份证有效证件，去网点申请注销。银行是无权单方面注销你的银行卡的。所以即使你长时间不用，账户也是正常的，也不会被注销。
那么唯一有影响的就是：长期不用的银行卡，会被银行限制非柜交易。银行主要是怕你的银行卡丢失或者被非法分子利用，从事一些违法的事情。所以会把你的网上支付功能全部取消，只留下柜面交易的功能。
但是是不影响你正常收款的，别人给你转账依然你是可以转进来的。但是转进来后，你只能再去柜台把钱取出来。想要网银转账是不可以的，如果想要解除这个非柜交易，那么只能去银行网点申请解除这个限制了。所以长期不用的银行卡，唯一的影响就是会被限制非柜交易。
总结一下：长期不用的农业银行卡，里面没有钱，银行是无法扣费的。因为储蓄卡是没有透支功能的。而且银行卡没有卡费，所以也不用担心被扣卡费。只要是在有效期内，银行是无法单方面注销的银行卡的，不过长期不使用的银行卡，会被限制非柜交易，所有的交易必须去网点柜台操作。